Entsprechend den Empfehlungen zur Diagnostik wird bei einzeln gehaltenen Tieren eine Behandlung nur empfohlen, wenn ein mit Giardien im Zusammenhang stehender Durchfall auftritt. Bei Multitierhaushalten und in Haushalten mit besonders gefährdeten Menschen sollte jedoch auch eine Behandlung aller Ausscheider überlegt werden.

Die Dauer der Behandlung wird vom Tierarzt/der Tierärztin festgelegt und beträgt in der Regel fünf Tage. Bei wiederkehrender Symptomatik kann das Behandlungsschema abgeändert und die Behandlung verlängert bzw. in Intervallen durchgeführt werden.